南宋末年，江南少年杨过自小父母双亡，被父亲生前结义兄弟、江湖上有名的大侠郭靖夫妻收养。杨过个性倔强，脾气顽劣，为郭靖的妻子黄蓉所不容，无奈之下，郭靖唯有把杨过送到当时号称天下武学正宗的全真教去学武。
      然而全真教教规森严，天性叛逆的杨过偏生又拜了心地狭窄的小人赵志敬为师，在教中吃尽苦头，忍无可忍，终于逃出全真教，被追打之下慌不择路，无意中逃进了活死人墓。
      活死人墓中隐居着一位少女，此女便是神雕女主角小龙女。她从小就生活在活死人墓中，不谙世事。孙婆婆临死前央求她收留杨过，最终她收留了杨过，并且收他为徒。从此师徒二人在墓中一起练武、一起长大，渐生情愫，如此这般度过了两年幸福时光。不过，不谙世事的两人却都不知道这就是世间至纯至真的爱情。后来李莫愁前来抢夺玉女心经，两人被迫走出墓中。小龙女却因被全真教甄志丙玷污，误以为是杨过，杨过懵然无知，愤而出走。杨过四处寻找小龙女，在寻找小龙女的过程中，遇上别的女子，从别的女孩对自己的情愫中，杨过才恍然明白小龙女对自己的感情，终于明白了爱情的味道。因为蒙古铁骑即将南下，中原武林大会，要结盟对抗蒙古人，却被蒙古国师金轮法王一伙人前来挑战，郭靖等人因对方接连使用卑鄙手段而陷入窘境。关键时刻，小龙女和杨过无意中卷入纷争，和郭靖等人一起打败了金轮法王。
郭靖等人佩服感谢小龙女，更为杨过骄傲，郭靖甚至要把自己亲生女郭芙许配杨过，但是杨过非但拒绝了这门亲事，反而说要娶小龙女为妻。此言一出，众人大惊——宋朝礼教森严，师徒通婚乃是大逆不道。二人爱情不能为这世俗所容。小龙女知道自己和杨过的爱情让杨过被众人唾弃，为了杨过能够被郭靖等人接受，她黯然离去，后来练功时因思念杨过走火入魔，却被绝情谷主所救，绝情谷主也被小龙女深深迷住，要娶她为妻，心如死灰的小龙女答应了。
     就在小龙女出嫁前夕，杨过找到了绝情谷中来，二人相逢，顿时爱情之火不可遏制，小龙女知道杨过对自己的感情始终未变，于是拒绝了绝情谷主的婚约，绝情谷主情急之下，用绝情谷独有的“情花”刺伤杨过，唯一能够解毒的办法，就是谷中特有的绝情丹……